RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463118.1

AKAP9-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-208	ENST00000463118	MTMR7	Q9Y216	660 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	MYH8	P13535	1937 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	BICDL2	A1A5D9	508 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	TADA3	O75528	432 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	TUBB2A	Q13885	445 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	CALCRL	Q16602	461 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	MB21D1	Q8N884	522 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	WNT2B	Q93097	391 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	CALML4	Q96GE6	196 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	IDI2	Q9BXS1	227 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	EXOC1	Q9NV70	894 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	OGFR	Q9NZT2	677 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	CRK	P46108	304 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	GNG11	P61952	73 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	GRB10	Q13322	594 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	MTF1	Q14872	753 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	ELF2	Q15723	593 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	STYK1	Q6J9G0	422 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	DCAF4	Q8WV16	495 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	P2RX5	Q93086	422 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	THAP11	Q96EK4	314 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	WDR24	Q96S15	920 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	RAB34	Q9BZG1	259 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	VPS16	Q9H269	839 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	TMEM260	Q9NX78	707 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	NYAP2	Q9P242	653 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	SIPA1L1	O43166	1804 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	ZBTB5	O15062	677 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	TEC	P42680	631 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	DNM2	P50570	870 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	MCTP2	Q6DN12	878 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	UNC13D	Q70J99	1090 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	SV2B	Q7L1I2	683 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	CUL5	Q93034	780 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	COA7	Q96BR5	231 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	IQCD	Q96DY2	449 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	TRIM47	Q96LD4	638 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	PNMA5	Q96PV4	448 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	DNAJC7	Q99615	494 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	ABCB11	O95342	1321 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		12.77	□□□□□ -0.36
AKAP9-208	ENST00000463118	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118		F8W031	263 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	SLC37A4	O43826	429 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	COBL	O75128	1261 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	MMP10	P09238	476 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	ERVK-24	P63145	666 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	ASIC1	P78348	528 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	UBXN1	Q04323	297 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	SEPT2	Q15019	361 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	MSS51	Q4VC12	460 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	FIGN	Q5HY92	759 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	DACT2	Q5SW24	774 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	HYI	Q5T013	277 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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