RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	TLE2	Q04725	743 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	RABEP1	Q15276	862 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	BICD2	Q8TD16	824 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	GTF3C6	Q969F1	213 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	IL17RA	Q96F46	866 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	SPATA33	Q96N06	139 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970		Q9Y3F1	56 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ESYT2	A0FGR8	921 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	FIBP	O43427	364 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	STAM2	O75886	525 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	CABYR	O75952	493 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ARHGAP1	Q07960	439 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	AP3B2	Q13367	1082 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	LAMC2	Q13753	1193 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	UIMC1	Q96RL1	719 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	KIF2C	Q99661	725 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ST18	O60284	1047 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	JAK2	O60674	1132 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	CTDNEP1	O95476	244 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	MMP3	P08254	477 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF286B	P0CG31	522 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	XBP1	P17861	261 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	SP2	Q02086	613 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	MTMR1	Q13613	665 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	WASF1	Q92558	559 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ALG1	Q9BT22	464 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ELP1	O95163	1332 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	KAT6A	Q92794	2004 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	STK36	Q9NRP7	1315 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970		A6NJR5	290 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ARVCF	O00192	962 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	KPNA6	O60684	536 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	TGFB3	P10600	412 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ITGB5	P18084	799 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	SREBF1	P36956	1147 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	NKX3-2	P78367	333 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	TRIM29	Q14134	588 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	NEDD9	Q14511	834 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	DGKD	Q16760	1214 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	MCTP2	Q6DN12	878 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	GPRASP2	Q96D09	838 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	CDHR1	Q96JP9	859 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	BACH2	Q9BYV9	841 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PSMD4-208	ENST00000462970	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		10.96	□□□□□ -0.66
PSMD4-208	ENST00000462970	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.66
PSMD4-208	ENST00000462970	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.96	□□□□□ -0.66
PSMD4-208	ENST00000462970	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		10.95	□□□□□ -0.66
PSMD4-208	ENST00000462970	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
PSMD4-208	ENST00000462970	CLTB	P09497	229 aa		10.95	□□□□□ -0.66
PSMD4-208	ENST00000462970	ICAM3	P32942	547 aa		10.95	□□□□□ -0.66
PSMD4-208	ENST00000462970	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
PSMD4-208	ENST00000462970	SNX17	Q15036	470 aa		10.95	□□□□□ -0.66
PSMD4-208	ENST00000462970	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.95	□□□□□ -0.66
PSMD4-208	ENST00000462970	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		10.95	□□□□□ -0.66
PSMD4-208	ENST00000462970	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		10.95	□□□□□ -0.66

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