RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 HIPK3Q9H422 1215 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 FIBPO43427 364 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 EVCP57679 992 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 SP2Q02086 613 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.821e-6■■□□□ 13.7
PTPN4-208ENST00000460289 NEDD9Q14511 834 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 UBE2SQ16763 222 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 C9orf50Q5SZB4 431 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 NLRX1Q86UT6 975 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 BARHL2Q9NY43 387 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPN4-208ENST00000460289 NID2Q14112 1375 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 CHMP4BP1P59074 171 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 KATNAL1Q9BW62 490 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
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PTPN4-208ENST00000460289 SMCO2A6NFE2 343 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 STXBP3O00186 592 aa26.37■■□□□ 1.81
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PTPN4-208ENST00000460289 CYP2C18P33260 490 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 EPHB4P54760 987 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 KAT2BQ92831 832 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 CDHR1Q96JP9 859 aa26.37■■□□□ 1.81
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PTPN4-208ENST00000460289 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 CSF2RAP15509 400 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 ADCY7P51828 1080 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 HSDL1Q3SXM5 330 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 SESTD1Q86VW0 696 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 GPRASP2Q96D09 838 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 SENP7Q9BQF6 1050 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 SORBS3O60504 671 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 SCG2P13521 617 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 METTL7BQ6UX53 244 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 NOD1Q9Y239 953 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 NOP56O00567 594 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 F2P00734 622 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 PSEN2P49810 448 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 C7orf31Q8N865 590 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
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PTPN4-208ENST00000460289 CYP2C9P11712 490 aa26.33■■□□□ 1.81
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PTPN4-208ENST00000460289 IL23AQ9NPF7 189 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 UMODL1Q5DID0 1318 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPN4-208ENST00000460289 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF286BP0CG31 522 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 IFNAR1P17181 557 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 CCL23P55773 120 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 ANAPC15P60006 121 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 NTRK3Q16288 839 aa26.32■■□□□ 1.8
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PTPN4-208ENST00000460289 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.32■■□□□ 1.8
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PTPN4-208ENST00000460289 C16orf59Q7L2K0 433 aa26.32■■□□□ 1.8
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PTPN4-208ENST00000460289 ALG1Q9BT22 464 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
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PTPN4-208ENST00000460289 SZT2Q5T011 3432 aa26.32■■□□□ 1.8
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PTPN4-208ENST00000460289 ITGB5P18084 799 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 AP3B2Q13367 1082 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 BFSP2Q13515 415 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM240Q5SV17 173 aa26.31■■□□□ 1.8
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PTPN4-208ENST00000460289 C6orf50Q9HD87 102 aa26.31■■□□□ 1.8
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PTPN4-208ENST00000460289 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 ESYT2A0FGR8 921 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 ACRP10323 421 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 MTMR1Q13613 665 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 PKN1Q16512 942 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 MCTP2Q6DN12 878 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 C16orf70Q9BSU1 422 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPN4-208ENST00000460289 SLC26A6Q9BXS9 759 aa26.3■■□□□ 1.8
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