RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SH3BP5-208ENST00000459627 MYSM1Q5VVJ2 828 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP5-208ENST00000459627 SPATA33Q96N06 139 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM260Q9NX78 707 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAMTS3O15072 1205 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 KPNA6O60684 536 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 CCL23P55773 120 aa27.45■■□□□ 1.98
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SH3BP5-208ENST00000459627 PCNX4Q63HM2 1172 aa27.45■■□□□ 1.98
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SH3BP5-208ENST00000459627 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
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SH3BP5-208ENST00000459627 ACRP10323 421 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 CSF2RAP15509 400 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 DGKDQ16760 1214 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 LRIT3Q3SXY7 679 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 FBXL16Q8N461 479 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 HIPK3Q9H422 1215 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 MLXIPQ9HAP2 919 aa27.44■■□□□ 1.98
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SH3BP5-208ENST00000459627 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 SMCO2A6NFE2 343 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 SPDYE3A6NKU9 549 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 STK3Q13188 491 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 GNPTABQ3T906 1256 aa27.43■■□□□ 1.98
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SH3BP5-208ENST00000459627 CYFIP1Q7L576 1253 aa27.43■■□□□ 1.98
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SH3BP5-208ENST00000459627 DTNBO60941 627 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 SEC24BO95487 1268 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 ICAM3P32942 547 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 PSEN2P49810 448 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 ADCY7P51828 1080 aa27.42■■□□□ 1.98
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SH3BP5-208ENST00000459627 NTRK3Q16288 839 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 PKN1Q16512 942 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 C16orf59Q7L2K0 433 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.42■■□□□ 1.98
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SH3BP5-208ENST00000459627 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 NID2Q14112 1375 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 FIBPO43427 364 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 SCG2P13521 617 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 Q7L0L9 218 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 SCLYQ96I15 445 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.982e-9■■□□□ 13.8
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SH3BP5-208ENST00000459627 TGFB3P10600 412 aa27.4■■□□□ 1.98
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SH3BP5-208ENST00000459627 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
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SH3BP5-208ENST00000459627 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP9AO75110 1047 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 EVCP57679 992 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 MFSD10Q14728 455 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM199Q8N511 208 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 ANO3Q9BYT9 981 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5-208ENST00000459627 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 XRRA1Q6P2D8 792 aa27.38■■□□□ 1.97
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SH3BP5-208ENST00000459627 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.37■■□□□ 1.97
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 PTGISQ16647 500 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM240Q5SV17 173 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 CYP2W1Q8TAV3 490 aa27.37■■□□□ 1.97
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SH3BP5-208ENST00000459627 IFNAR1P17181 557 aa27.36■■□□□ 1.97
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SH3BP5-208ENST00000459627 NEDD9Q14511 834 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 HIC1Q14526 733 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF365Q70YC5 407 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 CTAGE1Q96RT6 745 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 C16orf70Q9BSU1 422 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 NOD1Q9Y239 953 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 HAS3O00219 553 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 LGALS2P05162 132 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 CLK2P49760 499 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
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