RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPEP16870 476 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC37L1Q7L3B6 337 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COPS6Q7L5N1 327 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP1R14AQ96A00 147 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GBP3Q9H0R5 595 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATXN3LQ9H3M9 355 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DISC1Q9NRI5 854 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APEX2Q9UBZ4 518 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPDYE3A6NKU9 549 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAPNS1P04632 268 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPTP24298 496 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TM4SF1P30408 202 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NKG7Q16617 165 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKRD39Q53RE8 183 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM61Q5EBN2 209 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNNM4Q6P4Q7 775 aa10.51□□□□□ -0.73
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIF6Q6ZMV9 814 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHSY3Q70JA7 882 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPM1KQ8N3J5 372 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATL2Q8NHH9 583 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FANCD2OSQ96PS1 177 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYT17Q9BSW7 474 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCORQ6W2J9 1755 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRODHO43272 600 aa10.5□□□□□ -0.73
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERPINB2P05120 415 aa10.5□□□□□ -0.73
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SDSP20132 328 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLFN5Q08AF3 891 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 G2E3Q7L622 706 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AHI1Q8N157 1196 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGD4Q96M96 766 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CARMIL3Q8ND23 1372 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VAMP4O75379 141 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPM1BO75688 479 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CERS3Q8IU89 383 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BVESQ8NE79 360 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIN3Q8TB24 985 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OSBP2Q969R2 916 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WHRNQ9P202 907 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERBB4Q15303 1308 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0G2JLW4 131 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MEGF11A6BM72 1044 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOP56O00567 594 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALDH1L1O75891 902 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHRNA5P30532 468 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPHB1P54762 984 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC30Q5VVM6 783 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCAF15Q66K64 600 aa10.48□□□□□ -0.73
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 EDARADDQ8WWZ3 215 aa10.48□□□□□ -0.73
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBN2Q6ZU65 1347 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUP98P52948 1817 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPHP1O15259 732 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NID1P14543 1247 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRIA2P42262 883 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GUCY2FP51841 1108 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTLL4Q14679 1199 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POMZP3Q6PJE2 187 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPAS3Q8IXF0 933 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACDQ96AP0 544 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRGPRX3Q96LB0 322 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HYPKQ9NX55 129 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
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