RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 TTLL4Q14679 1199 aa12.57□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNA10Q16322 511 aa12.57□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 INF2Q27J81 1249 aa12.57□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa12.57□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.57□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 OR6J1Q8NGC5 347 aa12.57□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 TBCKQ8TEA7 893 aa12.57□□□□□ -0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 WASF1Q92558 559 aa12.57□□□□□ -0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 MXRA8Q9BRK3 442 aa12.56□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 AP5M1Q9H0R1 490 aa12.56□□□□□ -0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 HSDL1Q3SXM5 330 aa12.55□□□□□ -0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 SNX21Q969T3 373 aa12.55□□□□□ -0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 GLT8D2Q9H1C3 349 aa12.55□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 C11orf49Q9H6J7 331 aa12.55□□□□□ -0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 LRRC26Q2I0M4 334 aa12.54□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 CEP55Q53EZ4 464 aa12.54□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 PRR16Q569H4 304 aa12.54□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 XRRA1Q6P2D8 792 aa12.54□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 RNF180Q86T96 592 aa12.54□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 PLA2G4DQ86XP0 818 aa12.54□□□□□ -0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 EHMT1Q9H9B1 1298 aa12.54□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 PHF24Q9UPV7 400 aa12.54□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa12.53□□□□□ -0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1W2PQY0 241 aa12.53□□□□□ -0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 SLC37A4O43826 429 aa12.53□□□□□ -0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 CST5P28325 142 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 CHMP4BP1P59074 171 aa12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 NKX3-2P78367 333 aa12.53□□□□□ -0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 GNPTABQ3T906 1256 aa12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 GALNT17Q6IS24 598 aa12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 KRT25Q7Z3Z0 450 aa12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 NECAB2Q7Z6G3 386 aa12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 NLRX1Q86UT6 975 aa12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKLE1Q8NAG6 615 aa12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 GPRASP2Q96D09 838 aa12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 SPATA33Q96N06 139 aa12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 Q9Y3F1 56 aa12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 GRIN2DO15399 1336 aa12.53□□□□□ -0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 A6NJR5 290 aa12.52□□□□□ -0.41
RPRD1B-202ENST00000449186 DHX15O43143 795 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
RPRD1B-202ENST00000449186 STAM2O75886 525 aa12.52□□□□□ -0.41
RPRD1B-202ENST00000449186 CCNE2O96020 404 aa12.52□□□□□ -0.41
RPRD1B-202ENST00000449186 CIITAP33076 1130 aa12.52□□□□□ -0.41
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