RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 AFG1LQ8WV93 481 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 CD4P01730 458 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 MMP3P08254 477 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 TGFB3P10600 412 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 RAG1P15918 1043 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 LAMC2Q13753 1193 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 GNPTABQ3T906 1256 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 CHD9Q3L8U1 2897 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 STXBP3O00186 592 aa16.24■□□□□ 0.19
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SH3BP4-205ENST00000444916 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 NAPAP54920 295 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 UBE2SQ16763 222 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.24■□□□□ 0.19
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SH3BP4-205ENST00000444916 PPTC7Q8NI37 304 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
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SH3BP4-205ENST00000444916 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 GGPS1O95749 300 aa16.23■□□□□ 0.19
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SH3BP4-205ENST00000444916 DNAJB2P25686 324 aa16.23■□□□□ 0.19
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SH3BP4-205ENST00000444916 ADCY7P51828 1080 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 DGKDQ16760 1214 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
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SH3BP4-205ENST00000444916 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 DOCK5Q9H7D0 1870 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 FIBPO43427 364 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 B4GALT4O60513 344 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 SCG2P13521 617 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 COL9A1P20849 921 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 ANAPC15P60006 121 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 SP2Q02086 613 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 FPGSQ05932 587 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 SEMA3FQ13275 785 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 NBPF20Q3BBV1 942 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 SPATA33Q96N06 139 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 GLT8D2Q9H1C3 349 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 TRPV6Q9H1D0 765 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 PDRG1Q9NUG6 133 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM265A0A087WTH1 108 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 IFNAR1P17181 557 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 CCT2P78371 535 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 NTRK3Q16288 839 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 MFSD5Q6N075 450 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 NLRX1Q86UT6 975 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 PPM1EQ8WY54 764 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 PHKBQ93100 1093 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF576Q9H609 170 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-205ENST00000444916 SMCO2A6NFE2 343 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 GRXCR1A8MXD5 290 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 TNFRSF10AO00220 468 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 F2P00734 622 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 FOSP01100 380 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PBX2P40425 430 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 NEDD9Q14511 834 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PKN1Q16512 942 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM47CQ5HY64 1035 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 KAT2BQ92831 832 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 IL17RAQ96F46 866 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SENP7Q9BQF6 1050 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.189e-6■■■■■ 27.7
SH3BP4-205ENST00000444916 KATNAL1Q9BW62 490 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 HIPK3Q9H422 1215 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 MYO9BQ13459 2157 aa16.19■□□□□ 0.18
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