RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 G2E3Q7L622 706 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR142Q7Z601 462 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR152Q8TDT2 470 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FRMD6Q96NE9 622 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UIMC1Q96RL1 719 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMX1Q9H3N1 280 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF19AQ9NV58 838 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DMDP11532 3685 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CACNA1GO43497 2377 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UTYO14607 1347 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTC36A6NLP5 189 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRR33A8MZF0 331 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERC2O15083 957 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NRDCO43847 1150 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MICAL2O94851 1124 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLTBP09497 229 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCSK2P16519 638 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYP2C19P33261 490 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RGS3P49796 1198 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DAB2P98082 770 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPP2Q13103 211 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ICE2Q659A1 982 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRT40Q6A162 431 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLXNA3P51805 1871 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAST3O60307 1309 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KBTBD13C9JR72 458 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA0355O15063 1070 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYBAP13498 195 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAG1P15918 1043 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HERVK_113P62684 666 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP2B2Q01814 1243 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIF1AQ16665 826 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RASIP1Q5U651 963 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SUSD3Q96L08 255 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPRSQ13332 1948 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CACNA1FO60840 1977 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFXAPO00287 272 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OPLAHO14841 1288 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SORBS3O60504 671 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACRP10323 421 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYOGP15173 224 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAPK4P31152 587 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHKA2P46019 1235 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERVK-24P63145 666 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARID5AQ03989 594 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AAK1Q2M2I8 961 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAP9Q49MG5 647 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM240Q5SV17 173 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms