RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 F2P00734 622 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 HSD17B4P51659 736 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 TRDNQ13061 729 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 AAMPQ13685 434 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 TET1Q8NFU7 2136 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 WNT8BQ93098 351 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 OPLAHO14841 1288 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 CXCL10P02778 98 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 THPOP40225 353 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 PGM5Q15124 567 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 IL31RAQ8NI17 732 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 RAD9AQ99638 391 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 GJB5O95377 273 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 CCND2P30279 289 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 RBL2Q08999 1139 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 PIGSQ96S52 555 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 IL25Q9H293 177 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 ERICH2A1L162 156 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 HAS3O00219 553 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 LPXNO60711 386 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 EFCAB14O75071 495 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 RGS20O76081 388 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 POLR2MP0CAP2 368 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 TRANK1O15050 2925 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 MYH6P13533 1939 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 PPFIA4O75335 1185 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 LGR5O75473 907 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 HIC1Q14526 733 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 SEC23AQ15436 765 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-202ENST00000415164 LINC01553A4QN01 128 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.39■■□□□ 1.17
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UBXN4-202ENST00000415164 RSPH10BP0C881 870 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SP2Q02086 613 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 MBTPS1Q14703 1052 aa22.39■■□□□ 1.17
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UBXN4-202ENST00000415164 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 AMHP03971 560 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 GRM4Q14833 912 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 MTMR8Q96EF0 704 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 PTPRSQ13332 1948 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 EMSYQ7Z589 1322 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 ERVK-21P61565 698 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 GHRHRQ02643 423 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 TRAF1Q13077 416 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 WTAPQ15007 396 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SENP2Q9HC62 589 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 H3BRB1 525 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 LGALS2P05162 132 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SP4Q02446 784 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 GNPTABQ3T906 1256 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SERINC5Q86VE9 423 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 INSL6Q9Y581 213 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 TREHO43280 583 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 UPP2O95045 317 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 TGFB3P10600 412 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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