RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADAMTS3O15072 1205 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAG1P15918 1043 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLK2P49760 499 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 LAMC2Q13753 1193 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 SHHQ15465 462 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF20Q3BBV1 942 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 MFSD5Q6N075 450 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 NFRKBQ6P4R8 1299 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 C16orf59Q7L2K0 433 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 SESTD1Q86VW0 696 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 RIC8AQ9NPQ8 531 aa18.78■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 GGPS1O95749 300 aa18.77■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 F2P00734 622 aa18.77■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 HSDL1Q3SXM5 330 aa18.77■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 CUL5Q93034 780 aa18.77■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 WNT8AQ9H1J5 351 aa18.77■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 TELO2Q9Y4R8 837 aa18.77■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa18.77■□□□□ 0.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 ESYT2A0FGR8 921 aa18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 TLR3O15455 904 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 IFNAR1P17181 557 aa18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 ITGB5P18084 799 aa18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPR153Q6NV75 609 aa18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 C16orf70Q9BSU1 422 aa18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCDHA6Q9UN73 950 aa18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 WDR81Q562E7 1941 aa18.76■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 GBF1Q92538 1859 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 FIBPO43427 364 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 SEC24BO95487 1268 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCG2P13521 617 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 NAPAP54920 295 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANAPC15P60006 121 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 FPGSQ05932 587 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 DGKDQ16760 1214 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 RASIP1Q5U651 963 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 SENP7Q9BQF6 1050 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 RTEL1Q9NZ71 1219 aa18.75■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPFIA4O75335 1185 aa18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNA2P16389 499 aa18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 HOXC8P31273 242 aa18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYP2C18P33260 490 aa18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 FGD1P98174 961 aa18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 HIC1Q14526 733 aa18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 GNPTABQ3T906 1256 aa18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 METTL7BQ6UX53 244 aa18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPRASP2Q96D09 838 aa18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZMYND12Q9H0C1 365 aa18.74■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTPRSQ13332 1948 aa18.73■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP9AO75110 1047 aa18.73■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF286BP0CG31 522 aa18.73■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 CSF2RAP15509 400 aa18.73■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHKBQ93100 1093 aa18.73■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPATA33Q96N06 139 aa18.73■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANO3Q9BYT9 981 aa18.73■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 HIPK3Q9H422 1215 aa18.73■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMCO2A6NFE2 343 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYP2C9P11712 490 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 SREBF1P36956 1147 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 PSEN2P49810 448 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADCY7P51828 1080 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 RBL2Q08999 1139 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM240Q5SV17 173 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPR20Q99678 358 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.591e-16■□□□□ 8.9
NME1-NME2-202ENST00000393193 JADE2Q9NQC1 790 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM260Q9NX78 707 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 KAT6AQ92794 2004 aa18.72■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDH23Q9H251 3354 aa18.71■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.71■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPDYE3A6NKU9 549 aa18.71■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 EDIL3O43854 480 aa18.71■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 SORBS3O60504 671 aa18.71■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 AP3B2Q13367 1082 aa18.71■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 NEDD9Q14511 834 aa18.71■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 MFSD10Q14728 455 aa18.71■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYFIP1Q7L576 1253 aa18.71■□□□□ 0.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 PGBD1Q96JS3 809 aa18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms