RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDH22Q9UJ99 828 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-171P-201ENST00000384354 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.4□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPTBN2O15020 2390 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB11FIP3O75154 756 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 GLP2RO95838 553 aa6.39□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SP2Q02086 613 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 MFSD10Q14728 455 aa6.39□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM192Q8IY95 271 aa6.39□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.39□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.39□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.39□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.39□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP250Q9BV73 2442 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSPY2A6NKD2 308 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 GFRA3O60609 400 aa6.38□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 KPNA6O60684 536 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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RNU6-171P-201ENST00000384354 C7orf31Q8N865 590 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOP1MTQ969P6 601 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.37□□□□□ -1.39
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