RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.51□□□□□ -1.21
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RABGEF1-202ENST00000380828 BTBD6Q96KE9 485 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TESK2Q96S53 571 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPY26PQ9H489 355 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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RABGEF1-202ENST00000380828 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.5□□□□□ -1.21
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RABGEF1-202ENST00000380828 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 RSPH3Q86UC2 560 aa7.5□□□□□ -1.21
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RABGEF1-202ENST00000380828 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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RABGEF1-202ENST00000380828 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.5□□□□□ -1.21
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RABGEF1-202ENST00000380828 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 NCAM2O15394 837 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 RHOBTB3O94955 611 aa7.49□□□□□ -1.21
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