RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 TET1Q8NFU7 2136 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SORBS3O60504 671 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 B4GALT4O60513 344 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SCG2P13521 617 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 ADCY7P51828 1080 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SEMA3FQ13275 785 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 DGKDQ16760 1214 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PPTC7Q8NI37 304 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PHKBQ93100 1093 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SMCO2A6NFE2 343 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 FIBPO43427 364 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC34A2O95436 690 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 IFNAR1P17181 557 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PKN1Q16512 942 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 NLRX1Q86UT6 975 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 KAT2BQ92831 832 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SPATA33Q96N06 139 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SEC24BO95487 1268 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 CHMP4BP1P59074 171 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 FPGSQ05932 587 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 NEDD9Q14511 834 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SHHQ15465 462 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 MFSD5Q6N075 450 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 IL17RAQ96F46 866 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 MYO9BQ13459 2157 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 ESYT2A0FGR8 921 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PPFIA3O75145 1194 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PPFIA4O75335 1185 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF286BP0CG31 522 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 ITGB5P18084 799 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 CYP2C18P33260 490 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 EPHB4P54760 987 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 GPRASP2Q96D09 838 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PGBD1Q96JS3 809 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 ANO3Q9BYT9 981 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 HIPK3Q9H422 1215 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM260Q9NX78 707 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 F2P00734 622 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PSEN2P49810 448 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 STK3Q13188 491 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 AP3B2Q13367 1082 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 METTL7BQ6UX53 244 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 LRCH3Q96II8 777 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 EVPLQ92817 2033 aa21.14■□□□□ 0.98
SH3BP5-201ENST00000366391 HAS3O00219 553 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP5-201ENST00000366391 CYP2C9P11712 490 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP5-201ENST00000366391 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP5-201ENST00000366391 SESTD1Q86VW0 696 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM199Q8N511 208 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP5-201ENST00000366391 CDHR1Q96JP9 859 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP5-201ENST00000366391 ALG1Q9BT22 464 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP5-201ENST00000366391 C6orf50Q9HD87 102 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP5-201ENST00000366391 JADE2Q9NQC1 790 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP5-201ENST00000366391 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms