RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 SV2CQ496J9 727 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 RIOX2Q8IUF8 465 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 LZTR1Q8N653 840 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZBTB8AQ96BR9 441 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 MTA3Q9BTC8 594 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF747Q9BV97 191 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC113Q9H0I3 377 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 SIRPGQ9P1W8 387 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 INVSQ9Y283 1065 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 C7orf72A4D263 438 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 MROH6A6NGR9 719 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 THBDP07204 575 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 FGFR1P11362 822 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 TACR1P25103 407 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPL13P26373 211 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC6A11P48066 632 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 PURAQ00577 322 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 CYP4F3Q08477 520 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 RBL2Q08999 1139 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 RASGRF1Q13972 1273 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 LONRF2Q1L5Z9 754 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 DPY19L1Q2PZI1 675 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 DPH6Q7L8W6 267 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLEKHH3Q7Z736 793 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 LINC00482Q8N8I6 264 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 FRS2Q8WU20 508 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 BTN2A2Q8WVV5 523 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 MKL1Q969V6 931 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 C1orf159Q96HA4 380 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 PEX11GQ96HA9 241 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 NOX5Q96PH1 765 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRIM55Q9BYV6 548 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 TANGO6Q9C0B7 1094 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 KLC2Q9H0B6 622 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 LRP2BPQ9P2M1 347 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1W2PQU0 124 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 H7BY64 318 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 LAMTOR5O43504 91 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 MYO1BO43795 1136 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 CYP2C8P10632 490 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLS3P13797 630 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPL11P62913 178 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPP2R2AP63151 447 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 SERINC3Q13530 473 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 CHRNA2Q15822 529 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 MROH9Q5TGP6 573 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 WWC2Q6AWC2 1192 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 LIMS2Q7Z4I7 341 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 KREMEN2Q8NCW0 462 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 KCTD13Q8WZ19 329 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 DIO2Q92813 273 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPP1R14AQ96A00 147 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLEC1BQ9P126 229 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 X6R8D5 127 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 PDPK1O15530 556 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 THBS2P35442 1172 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 LTBRP36941 435 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 SELENOPP49908 381 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 KLF10Q13118 480 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 ICAM4Q14773 271 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 MBLAC2Q68D91 279 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 CYP4F22Q6NT55 531 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPIL6Q8IXY8 311 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLEKHO2Q8TD55 490 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 SEC14L1Q92503 715 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 AP5M1Q9H0R1 490 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 SEMA4AQ9H3S1 761 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 CD248Q9HCU0 757 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPRC5CQ9NQ84 441 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPR27Q9NS67 375 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF652Q9Y2D9 606 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAV20A0A0B4J274 112 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 C9orf118A6NHY6 69 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 TBX1O43435 398 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 AMHP03971 560 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 TGFB2P61812 414 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 INF2Q27J81 1249 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 EMC4Q5J8M3 183 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 CPNE8Q86YQ8 564 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-407P-201ENST00000365280 MIB1Q86YT6 1006 aa2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms