RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 KRT1P04264 644 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC8CQ8TDW0 803 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC39A14Q15043 492 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35F6Q8N357 371 aa24.3■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1841Q6NSI8 718 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP4P98171 946 aa24.3■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 ZMYND10O75800 440 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 NACC1Q96RE7 527 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 UBN1Q9NPG3 1134 aa24.29■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 SPDYE6P0CI01 402 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 SRGAP2BP0DMP2 458 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC93Q567U6 631 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 NLRP10Q86W26 655 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.29■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 BBOX1O75936 387 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 GPR108Q9NPR9 543 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 DBN1Q16643 649 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 DPCR1Q3MIW9 517 aa24.28■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 METP08581 1390 aa24.28■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 IFNAR2P48551 515 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 GSDMAQ96QA5 445 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 BBS5Q8N3I7 341 aa24.27■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 AK8Q96MA6 479 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 DNAAF3Q8N9W5 541 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 SGO2Q562F6 1265 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 OSBP2Q969R2 916 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 BAG5Q9UL15 447 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 PBRM1Q86U86 1689 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 CPP00450 1065 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 FTCDO95954 541 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 GPC4O75487 556 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 PSAPP07602 524 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
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