RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 TBCKQ8TEA7 893 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 JADE2Q9NQC1 790 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 NKX3-2P78367 333 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 TRIM29Q14134 588 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 ATP9AO75110 1047 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 BEX3Q00994 111 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 Q9Y3F1 56 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 MEIS1O00470 390 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 FIBPO43427 364 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 SORBS3O60504 671 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 ARP10275 920 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 ARHGAP1Q07960 439 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 INF2Q27J81 1249 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 GNPTABQ3T906 1256 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 CEP55Q53EZ4 464 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB11B-201ENST00000328024 TGFB3P10600 412 aa22.95■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.262e-7■■■■□ 24.6
RAB11B-201ENST00000328024 NLRX1Q86UT6 975 aa22.95■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.95■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.95■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.95■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 GPRASP2Q96D09 838 aa22.95■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.95■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 CIITAP33076 1130 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 KIF28PB7ZC32 967 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 DNM1LO00429 736 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF76P36508 570 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 USP11P51784 963 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 MTMR1Q13613 665 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 GNASQ5JWF2 1037 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 RNF180Q86T96 592 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 LENG9Q96B70 501 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 GGPS1O95749 300 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 GH1P01241 217 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 COL6A1P12109 1028 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 KCNA2P16389 499 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 KCNA10Q16322 511 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 UIMC1Q96RL1 719 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.92■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 TDP2O95551 362 aa22.92■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 CAPN2P17655 700 aa22.92■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.92■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 AFG1LQ8WV93 481 aa22.92■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 WNT7AO00755 349 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 SPC25Q9HBM1 224 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 KIF3AQ9Y496 699 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 A6NJR5 290 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 PRR16Q569H4 304 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 FERMT2Q96AC1 680 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 PHF24Q9UPV7 400 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 MAFGO15525 162 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 ASGR1P07306 291 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 CYP3A7P24462 503 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 RGS19P49795 217 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 ACLYP53396 1101 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 LETM2Q2VYF4 491 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 NEK8Q86SG6 692 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 MBOAT7Q96N66 472 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 KBTBD13C9JR72 458 aa22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms