RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.3■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 IL31RAQ8NI17 732 aa23.3■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.3■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF286BP0CG31 522 aa23.29■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.29■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 NEDD9Q14511 834 aa23.28■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.28■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.28■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 SLC9A7Q96T83 725 aa23.28■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.28■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.28■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.28■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 PIK3CDO00329 1044 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 SELPP16109 830 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 HAS3O00219 553 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 FIBPO43427 364 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 SORBS3O60504 671 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 BAIAP3O94812 1187 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 ICAM3P32942 547 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 PTK7Q13308 1070 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 FANCBQ8NB91 859 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 VWCEQ96DN2 955 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 A0A0C4DFX4 3053 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 KIF28PB7ZC32 967 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 RXRAP19793 462 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 KCNJ6P48051 423 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 RABGGTBP53611 331 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 SP2Q02086 613 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 RBL2Q08999 1139 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 METTL7BQ6UX53 244 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 NLRX1Q86UT6 975 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 MICU3Q86XE3 530 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 NEK1Q96PY6 1258 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 CDC45O75419 566 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 KRT32Q14532 448 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 USP26Q9BXU7 913 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 H3BRB1 525 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 MEIS2O14770 477 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 CKBP12277 381 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 CDHR1Q96JP9 859 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 LGALS2P05162 132 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 GNAT1P11488 350 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 IGFBP4P22692 258 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC9B-201ENST00000311308 EFCAB14O75071 495 aa23.2■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 MYOGP15173 224 aa23.2■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.2■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 EMSYQ7Z589 1322 aa23.19■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 ZBTB43O43298 467 aa23.19■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 CXCL10P02778 98 aa23.19■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 FGD1P98174 961 aa23.19■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 APOA5Q6Q788 366 aa23.19■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 SKAP1Q86WV1 359 aa23.19■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.19■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.19■■□□□ 1.3
TTC9B-201ENST00000311308 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms