RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 USP11P51784 963 aa9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-201ENST00000264345 COG1Q8WTW3 980 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-201ENST00000264345 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.71□□□□□ -0.85
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HERC3-201ENST00000264345 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 MEA1Q16626 185 aa9.7□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.7□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 ST7Q9NRC1 585 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.7□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.7□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 INPP5BP32019 993 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 CHURC1Q8WUH1 139 aa9.7□□□□□ -0.86
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