RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 SNX12Q9UMY4 172 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 TTLL1O95922 423 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 GUCY2FP51841 1108 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 CACNB3P54284 484 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PRR16Q569H4 304 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 MIIPQ5JXC2 388 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 MS4A14Q96JA4 679 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 ANO9A1A5B4 782 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 LRRC31Q6UY01 552 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 ZEB2O60315 1214 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 SLURP2P0DP57 97 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 TM4SF1P30408 202 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 CYP4A11Q02928 519 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 KCNK18Q7Z418 384 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 CETN3O15182 167 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 LRRC63Q05C16 580 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 COASYQ13057 564 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 MEA1Q16626 185 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 KCTD16Q68DU8 428 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 WDR93Q6P2C0 686 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 BARGINQ6ZT62 677 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.35■□□□□ 0.85
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LRP3-201ENST00000253193 POTEB3A0JP26 581 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 POTECB2RU33 542 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 FECHP22830 423 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 STAT3P40763 770 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 APBA1Q02410 837 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 SLC20A2Q08357 652 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 POTEBQ6S5H4 581 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 MYH6P13533 1939 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 CENPPQ6IPU0 288 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 M0R2N6 131 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PNMA5Q96PV4 448 aa20.34■□□□□ 0.85
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LRP3-201ENST00000253193 SH2D4AQ9H788 454 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PLA2G4BP0C869 781 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 MYBL2P10244 700 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 GUCY2DQ02846 1103 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 ASIC2Q16515 512 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PDE4CQ08493 712 aa20.33■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 USP21Q9UK80 565 aa20.33■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 ITGB4P16144 1822 aa20.33■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 PAPPAQ13219 1627 aa20.33■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 IQCDQ96DY2 449 aa20.33■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.33■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
LRP3-201ENST00000253193 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.33■□□□□ 0.85
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LRP3-201ENST00000253193 ZNF263O14978 683 aa20.33■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.33■□□□□ 0.84
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LRP3-201ENST00000253193 OPA1O60313 960 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 NR2F2P24468 414 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 ATP1A2P50993 1020 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 TAF1P21675 1872 aa20.32■□□□□ 0.84
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LRP3-201ENST00000253193 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 PALMO75781 387 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 CFAP58Q5T655 872 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 KRT12Q99456 494 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 ERMNQ8TAM6 284 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
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