RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 RASSF7Q02833 373 aa15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 MECOMQ03112 1051 aa15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 DDR1Q08345 913 aa15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 PTGISQ16647 500 aa15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 KCTD16Q68DU8 428 aa15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 OTUD6BQ8N6M0 293 aa15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 WHAMMQ8TF30 809 aa15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.01□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 GNPATO15228 680 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CAMTA2O94983 1202 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC63Q05C16 580 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC55Q6ZSA7 311 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 UNC13DQ70J99 1090 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 HPS3Q969F9 1004 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CABS1Q96KC9 395 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 EPB41L5Q9HCM4 733 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 SLC39A2Q9NP94 309 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 BUB1O43683 1085 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 MYBP10242 640 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 MNAT1P51948 309 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 GUCY2DQ02846 1103 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 STK32BQ9NY57 414 aa15□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 MDH1P40925 334 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 TFAP4Q01664 338 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 GUCY1A3Q02108 690 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ESYT3A0FGR9 886 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 KCNMA1Q12791 1236 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 PLCB4Q15147 1175 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 NAB2Q15742 525 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 SV2BQ7L1I2 683 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 NLRP14Q86W24 1093 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CALML4Q96GE6 196 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CEP72Q9P209 647 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 STK17AQ9UEE5 414 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 MYMKA6NI61 221 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 MYO1FO00160 1098 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 PALMO75781 387 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 NEK8Q86SG6 692 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 IFT81Q8WYA0 676 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 VCPKMTQ9H867 229 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 CES2O00748 559 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 TLR2O60603 784 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 FAM107AO95990 144 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 SERPING1P05155 500 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 TECP42680 631 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 EHHADHQ08426 723 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 GRB10Q13322 594 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 SLC15A2Q16348 729 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 LETM2Q2VYF4 491 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms