RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 GDAQ9Y2T3 454 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USO1O60763 962 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 KRT9P35527 623 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 GAS7O60861 476 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 KRT83P78385 493 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 ARHGAP4P98171 946 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 ARID5BQ14865 1188 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 FAM83BQ5T0W9 1011 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 PPP4R3AQ6IN85 833 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 UIMC1Q96RL1 719 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 MMRN2Q9H8L6 949 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 PANK4Q9NVE7 773 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 FEM1BQ9UK73 627 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 POTEMA6NI47 508 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP14P54578 494 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 UNC13DQ70J99 1090 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 GMCL1Q96IK5 515 aa11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 CHMP2AO43633 222 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 SLU7O95391 586 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 PRCPP42785 496 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 MMP14P50281 582 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 HUNKP57058 714 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 NCAPHQ15003 741 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 PRELPP51888 382 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 SNAP25P60880 206 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 TCERG1LQ5VWI1 586 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 NEK11Q8NG66 645 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 MKL1Q969V6 931 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 FAM20AQ96MK3 541 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.77□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 CETN3O15182 167 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 ZFPM1Q8IX07 1006 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 GNA14O95837 355 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 SYCP3Q8IZU3 236 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 CAGE1Q8TC20 777 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 RAD54LQ92698 747 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM9Q9C026 710 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 SLC26A4O43511 780 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 FLOT1O75955 427 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 KRT31Q15323 416 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.76□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 RHOBTB3O94955 611 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 ALAS1P13196 640 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 COBLO75128 1261 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 DPF2Q92785 391 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 PANX2Q96RD6 677 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 SPC25Q9HBM1 224 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 SCN4AP35499 1836 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 ABCB11O95342 1321 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 NFKBIEO00221 500 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 AKR1B10O60218 316 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 PLA2G4BP0C869 781 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 SNHG28P0DPA3 235 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC42Q96M95 316 aa11.75□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 TEKT3Q9BXF9 490 aa11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms