RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 NLRP5P59047 1200 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 AFG1LQ8WV93 481 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 CEP290O15078 2479 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 GRIN2DO15399 1336 aa25.48■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 ELP1O95163 1332 aa25.48■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 GNPTABQ3T906 1256 aa25.48■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.48■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 JADE2Q9NQC1 790 aa25.48■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.48■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 FIBPO43427 364 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 EVI5O60447 810 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 ATP9AO75110 1047 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 CYP3A4P08684 503 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 CPT1AP50416 773 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 CDK7P50613 346 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 RTP1P59025 263 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP4P98171 946 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 IL27Q8NEV9 243 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 BICD2Q8TD16 824 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 GPRASP2Q96D09 838 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 STARD7Q9NQZ5 370 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 SORBS3O60504 671 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 GGPS1O95749 300 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 MMP3P08254 477 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 LAMC2Q13753 1193 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 TRIM60Q495X7 471 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 MCTP2Q6DN12 878 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 GLT1D1Q96MS3 346 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 ALG1Q9BT22 464 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 MEIS1O00470 390 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 ST18O60284 1047 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 ZEB2O60315 1214 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 KCNA2P16389 499 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 NLRX1Q86UT6 975 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 C7orf61Q8IZ16 206 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 BLIDQ8IZY5 108 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa25.44■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 FAM86B1E9PN63 330 aa25.44■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 H0YGN5 161 aa25.44■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 CABYRO75952 493 aa25.44■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.44■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 ARP10275 920 aa25.44■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 CEP55Q53EZ4 464 aa25.44■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 GALNT17Q6IS24 598 aa25.44■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 PPTC7Q8NI37 304 aa25.44■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 ARVCFO00192 962 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 MYL3P08590 195 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 PSMC6P62333 389 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 TLE2Q04725 743 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 OXER1Q8TDS5 423 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 WASF1Q92558 559 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 KAT2BQ92831 832 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 TMX3Q96JJ7 454 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.42■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 MAFGO15525 162 aa25.42■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 CIITAP33076 1130 aa25.42■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 MTMR1Q13613 665 aa25.42■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 NEDD9Q14511 834 aa25.42■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 METTL7BQ6UX53 244 aa25.42■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.42■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 SPATA33Q96N06 139 aa25.42■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 KPNA6O60684 536 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 ITGA7Q13683 1181 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 VTI1AQ96AJ9 217 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 CDHR1Q96JP9 859 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 TOX2Q96NM4 488 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 NR2E3Q9Y5X4 410 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF25Q93038 417 aa25.4■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 PPFIA4O75335 1185 aa25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 XBP1P17861 261 aa25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 553.7 ms