RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM37O94972 964 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 UNC13DQ70J99 1090 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC51AQ86UW1 340 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 EHD4Q9H223 541 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 JAG2Q9Y219 1238 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 SERPINB2P05120 415 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 RRAGAQ7L523 313 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 RPAINQ86UA6 219 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 OTUD6BQ8N6M0 293 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 CES2O00748 559 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 SV2BQ7L1I2 683 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 PROM2Q8N271 834 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.2■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 LSP1P33241 339 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 PSMD2Q13200 908 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 PDCLQ13371 301 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 DDR1Q08345 913 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 PLCB4Q15147 1175 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 C3orf20Q8ND61 904 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 EPHB6O15197 1021 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 GNA11P29992 359 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 DRP2Q13474 957 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 MTMR8Q96EF0 704 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF233A6NK53 670 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP1R37O75864 691 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 CXCR5P32302 372 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 FNTAP49354 379 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 TFAP4Q01664 338 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 HGSNATQ68CP4 663 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 CABS1Q96KC9 395 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 CEP72Q9P209 647 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 SERPING1P05155 500 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 NR1D1P20393 614 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 CRY2Q49AN0 593 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 LRIG3Q6UXM1 1119 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 NEK8Q86SG6 692 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 TSG101Q99816 390 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 SALL4Q9UJQ4 1053 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 GLI1P08151 1106 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 NAB2Q15742 525 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 C6orf50Q9HD87 102 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 GPSM2P81274 684 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 RASSF7Q02833 373 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 EPB41L5Q9HCM4 733 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 NFU1Q9UMS0 254 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 SAMM50Q9Y512 469 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 NCK2O43639 380 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT14P02533 472 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 SMARCA1P28370 1054 aa25.16■■□□□ 1.62
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ANKRD54-201ENST00000215941 CARSP49589 748 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 MNAT1P51948 309 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 TNNC1P63316 161 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 PTGISQ16647 500 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 NAA35Q5VZE5 725 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 CYTH3O43739 400 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC1A4P43007 532 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD54-201ENST00000215941 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
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