RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	SRP14	P38985	146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	LYS9	P38999	446 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	AIM2	P39721	246 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	YGR201C	P42936	225 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	SBH2	P52871	88 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	NGL3	Q03210	505 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	TOS4	Q06266	489 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	YEH1	Q07804	573 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	GSH2	Q08220	491 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	BSC6	Q08280	497 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	BBP1	Q12365	385 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	AI1	P03875	834 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	AMS1	P22855	1083 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	PER1	P25625	357 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	SQT1	P35184	431 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	PPS1	P38148	807 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	YBL029W	P38201	376 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	PSD1	P39006	500 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	COS4	P43542	379 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	YGL176C	P46945	554 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	SCY1	P53009	804 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	COS6	P53344	381 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	EEB1	Q02891	456 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	YDC1	Q02896	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	FAR8	Q05040	523 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	CRT10	Q08226	957 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	APC9	Q12107	265 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	NBP2	Q12163	236 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	VAM3	Q12241	283 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	ZRC1	P20107	442 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	AMD2	P22580	549 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	PET18	P25362	215 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	HXT4	P32467	576 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	ISC10	P32645	267 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	CSG2	P35206	410 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	SCO2	P38072	301 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	DTR1	P38125	572 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	DUN1	P39009	513 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	RGI2	P40188	164 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	PRM2	P40534	656 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	IMO32	P53219	342 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	YHM2	Q04013	314 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	CTI6	Q08923	506 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	FIG2	P25653	1609 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PXA1	YPL147W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	GCR1	P07261	785 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	REV1	P12689	985 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RBK1	P25332	333 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RER2	P35196	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	DRE2	P36152	348 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	FAT1	P38225	669 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	UBA4	P38820	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	CCT6	P39079	546 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	BUR6	P40096	142 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	IRC7	P43623	340 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	AAT1	Q01802	451 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	CUR1	Q06469	252 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	FRE5	Q08908	694 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PER33	Q12144	273 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SUL2	Q12325	893 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	UGA1	P17649	471 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PBN1	P25580	416 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MDL2	P33311	773 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SEF1	P34228	1148 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MCH2	P36032	473 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YJL132W	P47014	750 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YJR149W	P47177	404 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MRX6	P48564	524 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	REG1	Q00816	1014 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	GIS1	Q03833	894 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RTT109	Q07794	436 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MCH5	Q08777	521 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.5 ms