RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
TRS33	YOR115C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HMT1	P38074	348 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YBR225W	P38321	900 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SLX1	P38324	304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YBR259W	P38338	688 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YHR202W	P38887	602 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HAT2	P39984	401 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SNL1	P40548	159 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	IAH1	P41734	238 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CHA4	P43634	648 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	RTT101	P47050	842 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SAP4	P53036	818 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YGL108C	P53139	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	GPI1	P53306	609 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YNL033W	P53964	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YNL019C	P53975	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HER2	Q03557	464 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HSP31	Q04432	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ATG17	Q06410	417 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	LDB18	Q07887	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	NSE1	Q07913	336 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	GET4	Q12125	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	NTO1	Q12311	748 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	TPK2	P06245	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CMP2	P14747	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PHO81	P17442	1178 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	UGA1	P17649	471 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PMA2	P19657	947 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SGF29	P25554	259 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	DCC1	P25559	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CSM1	P25651	190 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	DBF20	P32328	564 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	VPH2	P32341	215 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	KAR9	P32526	644 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SKT5	P34226	696 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	UIP5	P36137	443 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ARP1	P38696	384 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SFB3	P38810	929 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	APE4	P38821	490 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CYC2	P38909	366 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MET18	P40469	1032 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MET12	P46151	657 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	IMA1	P53051	589 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	GTR2	P53290	341 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HOL1	P53389	586 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	IBD2	P53892	351 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PLB2	Q03674	706 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	BLS1	Q06071	122 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YOL019W	Q08157	551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MUM3	Q08750	479 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	GPB1	Q08886	897 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PSY3	Q12318	242 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ARG81	P05085	880 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	HEM2	P05373	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	COS2	P0CX12	379 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	COS3	P0CX13	379 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	CNA1	P23287	553 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	CIN8	P27895	1000 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ATP7	P30902	174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MRPL9	P31334	269 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SKG1	P36169	355 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ECM13	P38195	257 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	IST2	P38250	946 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	EFM1	P38732	585 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	FAD1	P38913	306 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RGI2	P40188	164 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PFA3	P42836	336 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	COS4	P43542	379 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	BST1	P43571	1029 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PTR3	P43606	678 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RMD8	P43620	662 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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