RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	ATP25	Q03153	612 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	HRD1	Q08109	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GIS3	Q12418	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PTC5	Q12511	572 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SIT4	P20604	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
BLM10	YFL007W	COT1	P32798	439 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YPT53	P36019	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MEP2	P41948	499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PMR1	P13586	950 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MRPL44	P19956	98 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	CHL4	P38907	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	END3	P39013	349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	OXA1	P39952	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GPI1	P53306	609 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MAL13	P53338	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YTP1	P53584	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SPC29	P33419	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	APD1	P38281	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	LYS9	P38999	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ECM27	P47144	725 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	NPY1	P53164	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	POP6	P53218	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YRR1	Q12172	810 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SPS2	P08459	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ERG11	P10614	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	FKH1	P40466	484 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	KTR7	P40504	517 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ECL1	P48235	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	AMA1	P50082	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	HFI1	Q12060	488 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	TRK1	P12685	1235 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ORC2	P32833	620 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MNS1	P32906	549 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	AST1	P35183	429 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	BNA4	P38169	460 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	VPS28	Q02767	242 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MAK3	Q03503	176 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ARG81	P05085	880 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CKI1	P20485	582 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SEC61	P32915	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PHO11	P35842	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PHO12	P38693	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ARG2	P40360	574 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	LYS14	P40971	790 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SPG5	P42933	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	AIM14	P53109	570 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SRF1	Q12516	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HAP3	P13434	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SPC34	P36131	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GTT3	P39996	337 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TGS1	Q12052	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	BAS1	P22035	811 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ATG22	P25568	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ADE1	P27616	306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	UPS2	P35200	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YJL206C	P39529	758 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YER010C	P40011	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HXT16	P47185	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YGL108C	P53139	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GCR2	Q01722	534 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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