RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	DNM2	P50570	870 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	GRB10	Q13322	594 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	RASA3	Q14644	834 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	RETREG2	Q8NC44	543 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	KIFC2	Q96AC6	838 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	PLIN2	Q99541	437 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	MAF1	Q9H063	256 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	DNM3	Q9UQ16	869 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		9.28	□□□□□ -0.92
PNKP-231	ENST00000640501		A0A1W2PRG0	241 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	POTEM	A6NI47	508 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	KLRC4	O43908	158 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ZBED4	O75132	1171 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CFB	P00751	764 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC175	P0C221	793 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	IDE	P14735	1019 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CASP1	P29466	404 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	UBXN1	Q04323	297 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	KRT31	Q15323	416 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PRR16	Q569H4	304 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	NEK9	Q8TD19	979 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MAP7D2	Q96T17	732 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MTR	Q99707	1265 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TMX1	Q9H3N1	280 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PICK1	Q9NRD5	415 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	GDA	Q9Y2T3	454 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ICAM1	P05362	532 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	RPA1	P27694	616 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ECE1	P42892	770 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MCM6	Q14566	821 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MICALL2	Q8IY33	904 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	DDX12P	Q92771	950 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	HAS1	Q92839	578 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PNMA5	Q96PV4	448 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PANK4	Q9NVE7	773 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	KCND2	Q9NZV8	630 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	COL4A5	P29400	1685 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	DOCK1	Q14185	1865 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	LGALS16	A8MUM7	142 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	FZD9	O00144	591 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	NFKBIE	O00221	500 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MFAP3L	O75121	409 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PLA2G4B	P0C869	781 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	GAP43	P17677	238 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ARID5B	Q14865	1188 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SYCP1	Q15431	976 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		9.25	□□□□□ -0.93

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