RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHA12Q9UN75 941 aa28.11■■■□□ 2.09
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CAPNS1-215ENST00000628018 UBA7P41226 1012 aa28.1■■■□□ 2.09
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CAPNS1-215ENST00000628018 ARP10275 920 aa28.02■■■□□ 2.08
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CAPNS1-215ENST00000628018 KRT79Q5XKE5 535 aa28.02■■■□□ 2.08
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