RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614198.4

GGA3-221, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 3,438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-221	ENST00000614198	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198		H3BQF6	201 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	TRAF5	O00463	557 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	HMGCS2	P54868	508 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	E2F4	Q16254	413 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	POTEC	B2RU33	542 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	PTPRE	P23469	700 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	SYK	P43405	635 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	AFM	P43652	599 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	STAT2	P52630	851 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	RESP18	Q5W5W9	173 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	DHX58	Q96C10	678 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	MAP2K7	O14733	419 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	SERPINC1	P01008	464 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	CMA1	P23946	247 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	ADCY7	P51828	1080 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	CORO7	P57737	925 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	VCPKMT	Q9H867	229 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	FANCG	O15287	622 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	TBC1D12	O60347	775 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	PPP6R2	O75170	966 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	ASNS	P08243	561 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	RABGGTA	Q92696	567 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	C6orf50	Q9HD87	102 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	MEIS2	O14770	477 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	CP	P00450	1065 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	CFB	P00751	764 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	TEC	P42680	631 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	MCM6	Q14566	821 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	DCAF4	Q8WV16	495 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	MTMR8	Q96EF0	704 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	PTPRA	P18433	802 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	CALML3	P27482	149 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	TXK	P42681	527 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	GMCL1	Q96IK5	515 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	HPSE	Q9Y251	543 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	CEP83	Q9Y592	693 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC151	A5D8V7	595 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC172	P0C7W6	258 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	VCAM1	P19320	739 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	GNG11	P61952	73 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	MAP3K9	P80192	1104 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	VGLL4	Q14135	290 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	FBXO11	Q86XK2	927 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198		A0A1W2PQ27	194 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198		A0A1W2PQ64	194 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198		A0A1W2PQD8	194 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	POTEM	A6NI47	508 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	FLOT1	O75955	427 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	BRD3	Q15059	726 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63

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