RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 FAM184BQ9ULE4 1060 aa15.26■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 USP8P40818 1118 aa15.25■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 IFFO1Q0D2I5 559 aa15.25■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 NAA35Q5VZE5 725 aa15.25■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.25■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 GPBP1Q86WP2 473 aa15.25■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 GPATCH11Q8N954 259 aa15.25■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 DNAJC7Q99615 494 aa15.25■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 TCP10Q12799 353 aa15.25■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 GLIS3Q8NEA6 775 aa15.25■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 AK8Q96MA6 479 aa15.25■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 SNX12Q9UMY4 172 aa15.25■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 ASIC2Q16515 512 aa15.24■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 CEP85LQ5SZL2 805 aa15.24■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.24■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 TLDC2A0PJX2 215 aa15.24■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 E9PMD0 336 aa15.24■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 PPFIA4O75335 1185 aa15.24■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 PALMO75781 387 aa15.24■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.24■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.24■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa15.23■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 KRT14P02533 472 aa15.23■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 AMPD2Q01433 879 aa15.23■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 ADAM9Q13443 819 aa15.23■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 GALNT17Q6IS24 598 aa15.23■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.032e-7■■□□□ 14.5
HPS1-215ENST00000613394 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 AP1M1Q9BXS5 423 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 CUEDC2Q9H467 287 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 FAM196BA6NMK8 535 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 RASA1P20936 1047 aa15.22■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 USP17L15C9J2P7 530 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 USP17L11C9JVI0 530 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 USP17L18D6R9N7 530 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 USP17L22D6RA61 530 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 USP17L19D6RCP7 530 aa15.22■□□□□ 0.03
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HPS1-215ENST00000613394 USP17L24Q0WX57 530 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 NNTQ13423 1086 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 VPS36Q86VN1 386 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 PAK2Q13177 524 aa15.21■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.21■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 WDR93Q6P2C0 686 aa15.21■□□□□ 0.03
HPS1-215ENST00000613394 RDH13Q8NBN7 331 aa15.21■□□□□ 0.03
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