RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593708.1

USF2-204, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-204ENST00000593708 PTGISQ16647 500 aa25.16■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.16■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 ASB2Q96Q27 587 aa25.16■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 EPOPA6NHQ4 379 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 SEC23AQ15436 765 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 STXBP2Q15833 593 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 SESTD1Q86VW0 696 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 RETREG2Q8NC44 543 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 IWS1Q96ST2 819 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 KRT23Q9C075 422 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 PXMP2Q9NR77 195 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 NOD1Q9Y239 953 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 RFXAPO00287 272 aa25.14■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 ACTN1P12814 892 aa25.14■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 HSD17B4P51659 736 aa25.14■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 BFSP2Q13515 415 aa25.14■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.14■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.14■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 CERS4Q9HA82 394 aa25.14■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.14■■□□□ 1.62
USF2-204ENST00000593708 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 BRWD1Q9NSI6 2320 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 CFBP00751 764 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 PDE4AP27815 886 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 GHRHRQ02643 423 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 MTMR8Q96EF0 704 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 SLC9A7Q96T83 725 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 RGS20O76081 388 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 NR3C2P08235 984 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 ZNF286BP0CG31 522 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 SPRED2Q7Z698 418 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 HERC6Q8IVU3 1022 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 MICALL1Q8N3F8 863 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 AMNQ9BXJ7 453 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 KLRF2D3W0D1 207 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 TNFRSF10AO00220 468 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 TAP1Q03518 808 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 IL31RAQ8NI17 732 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 CAGE1Q8TC20 777 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 DGKDQ16760 1214 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 TCTN1Q2MV58 587 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 KRT40Q6A162 431 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 SENP2Q9HC62 589 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 ZBTB5O15062 677 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 F2P00734 622 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 PSEN2P49810 448 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 TFF2Q03403 129 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 RBL2Q08999 1139 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 PPTC7Q8NI37 304 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 WNT8BQ93098 351 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 MTCH2Q9Y6C9 303 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 SORBS3O60504 671 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 BAIAP3O94812 1187 aa25.08■■□□□ 1.61
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USF2-204ENST00000593708 HIC1Q14526 733 aa25.08■■□□□ 1.61
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USF2-204ENST00000593708 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-204ENST00000593708 LCHNA4D1U4 455 aa25.07■■□□□ 1.6
USF2-204ENST00000593708 HAS3O00219 553 aa25.07■■□□□ 1.6
USF2-204ENST00000593708 NBNO60934 754 aa25.07■■□□□ 1.6
USF2-204ENST00000593708 CKBP12277 381 aa25.07■■□□□ 1.6
USF2-204ENST00000593708 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
USF2-204ENST00000593708 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
USF2-204ENST00000593708 WDR5P61964 334 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
USF2-204ENST00000593708 PTH1RQ03431 593 aa25.07■■□□□ 1.6
USF2-204ENST00000593708 LAMC2Q13753 1193 aa25.07■■□□□ 1.6
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