RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	NT5C2	P49902	561 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	TFF2	Q03403	129 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	KRT23	Q9C075	422 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	MAF1	Q9H063	256 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	SORBS3	O60504	671 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	SELP	P16109	830 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	PSEN2	P49810	448 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	KCNQ1	P51787	676 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	TAP1	Q03518	808 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	KRT40	Q6A162	431 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	NR3C2	P08235	984 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	BMP1	P13497	986 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	PDE4A	P27815	886 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	MFSD10	Q14728	455 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	KAT2B	Q92831	832 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	LCT	P09848	1927 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	CKB	P12277	381 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	GRB10	Q13322	594 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	COG5	Q9UP83	839 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	TRDN	Q13061	729 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	PTK7	Q13308	1070 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	IKBKE	Q14164	716 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	HLA-C	Q95604	372 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	NBN	O60934	754 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	DEFB103A	P81534	67 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	GBF1	Q92538	1859 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	ERICH2	A1L162	156 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	ZBTB5	O15062	677 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	EFCAB14	O75071	495 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	GGPS1	O95749	300 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	THPO	P40225	353 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	HSD17B4	P51659	736 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	TRAF1	Q13077	416 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	GPNMB	Q14956	572 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31

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