RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 COL6A3P12111 3177 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 REC8O95072 547 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 GH1P01241 217 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 SMARCA1P28370 1054 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CDK7P50613 346 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 HSD17B4P51659 736 aa9.61□□□□□ -0.87
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PTPRM-214ENST00000583153 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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PTPRM-214ENST00000583153 LRCH3Q96II8 777 aa9.6□□□□□ -0.87
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PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.6□□□□□ -0.87
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PTPRM-214ENST00000583153 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 HIPK3Q9H422 1215 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 NOD1Q9Y239 953 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 GRIN2DO15399 1336 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 EYSQ5T1H1 3165 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 CD4P01730 458 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRM-214ENST00000583153 TGFB3P10600 412 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 CSF2RAP15509 400 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 CYP2C18P33260 490 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
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