RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581525.1

SNORD55-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 55, humanhuman

BASIC

Gene SNORD55, Length 80 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD55-201ENST00000581525 TTLL4Q14679 1199 aa14.53□□□□□ -0.08
SNORD55-201ENST00000581525 GNASQ5JWF2 1037 aa14.53□□□□□ -0.08
SNORD55-201ENST00000581525 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.53□□□□□ -0.08
SNORD55-201ENST00000581525 IL31RAQ8NI17 732 aa14.53□□□□□ -0.08
SNORD55-201ENST00000581525 CUL5Q93034 780 aa14.53□□□□□ -0.08
SNORD55-201ENST00000581525 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.53□□□□□ -0.08
SNORD55-201ENST00000581525 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.53□□□□□ -0.08
SNORD55-201ENST00000581525 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.53□□□□□ -0.08
SNORD55-201ENST00000581525 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 CCND2P30279 289 aa14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 AK2P54819 239 aa14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 TOX2Q96NM4 488 aa14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 PRO3102Q9H379 93 aa14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.52□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 ALPK3Q96L96 1907 aa14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SMCO2A6NFE2 343 aa14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 H0YGN5 161 aa14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 ZEB2O60315 1214 aa14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 KPNA6O60684 536 aa14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 ARHGAP1Q07960 439 aa14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 MCTP2Q6DN12 878 aa14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.51□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 MAFGO15525 162 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 GH1P01241 217 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 PTGS1P23219 599 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 CPT1AP50416 773 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 NEK4P51957 841 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 NAPAP54920 295 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 RTP1P59025 263 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 BEX3Q00994 111 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SP2Q02086 613 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SCRN1Q12765 414 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 AP3B2Q13367 1082 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 LY6KQ17RY6 165 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 COPS5Q92905 334 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 PHKBQ93100 1093 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 FERMT2Q96AC1 680 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.5□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 GRIN2DO15399 1336 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 ARVCFO00192 962 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 DEXIO95424 95 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SEMA3FQ13275 785 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 LAMC2Q13753 1193 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 UBE2SQ16763 222 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 ME3Q16798 604 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 GPRASP2Q96D09 838 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 GDF15Q99988 308 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.49□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 FIBPO43427 364 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 CTDNEP1O95476 244 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 CYP3A4P08684 503 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 GNA11P29992 359 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 BMP8BP34820 402 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SREBF1P36956 1147 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 ADCY7P51828 1080 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 GNPTABQ3T906 1256 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 C6orf50Q9HD87 102 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.48□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 STK36Q9NRP7 1315 aa14.47□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.47□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 M0R2N6 131 aa14.47□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 ADAMTS3O15072 1205 aa14.47□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 PPFIA4O75335 1185 aa14.47□□□□□ -0.09
SNORD55-201ENST00000581525 CD4P01730 458 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms