RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577435.5

GGA3-203, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-203ENST00000577435 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
GGA3-203ENST00000577435 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.09■□□□□ 0.17
GGA3-203ENST00000577435 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
GGA3-203ENST00000577435 A0A1W2PPC1 479 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 KPNA6O60684 536 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 STAM2O75886 525 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 TGFB3P10600 412 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 CCND2P30279 289 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 USP17L6PQ6QN14 398 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 COPS5Q92905 334 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 VTI1AQ96AJ9 217 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 POLR3EQ9NVU0 708 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 DCDC2CA8MYV0 355 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 GH1P01241 217 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 NTRK3Q16288 839 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 LY6KQ17RY6 165 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 IL31RAQ8NI17 732 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PDLIM7Q9NR12 457 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 GRIN2DO15399 1336 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 KIAA0355O15063 1070 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 CLTBP09497 229 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 ICAM3P32942 547 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 ARHGAP1Q07960 439 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 FAAP100Q0VG06 881 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 ITGA7Q13683 1181 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 GLT8D2Q9H1C3 349 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 BARHL2Q9NY43 387 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 MRVI1Q9Y6F6 885 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 STXBP3O00186 592 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 IFNAR1P17181 557 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 LAMC2Q13753 1193 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 GNPTABQ3T906 1256 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PDRG1Q9NUG6 133 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 LTBP2Q14767 1821 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 CD4P01730 458 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 NAPAP54920 295 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PKN1Q16512 942 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 MYSM1Q5VVJ2 828 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 FAM126BQ8IXS8 530 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 AFG1LQ8WV93 481 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 ESYT2A0FGR8 921 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 SMCO2A6NFE2 343 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 SEC24BO95487 1268 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 FOSP01100 380 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 MYL3P08590 195 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 SCG2P13521 617 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 SP2Q02086 613 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PPTC7Q8NI37 304 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 TBX21Q9UL17 535 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 LAMA3Q16787 3333 aa16.02■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 FIBPO43427 364 aa16.02■□□□□ 0.16
GGA3-203ENST00000577435 PPFIA4O75335 1185 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms