RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570979.1

SPNS2-203, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS2, Length 1,768 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-203ENST00000570979 CUL5Q93034 780 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS2-203ENST00000570979 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS2-203ENST00000570979 PDIA5Q14554 519 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS2-203ENST00000570979 CCDC96Q2M329 555 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS2-203ENST00000570979 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS2-203ENST00000570979 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS2-203ENST00000570979 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS2-203ENST00000570979 TBCKQ8TEA7 893 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS2-203ENST00000570979 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS2-203ENST00000570979 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 CABP7Q86V35 215 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 MTMR8Q96EF0 704 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 A0A1B0GTH6 734 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 BTBD19C9JJ37 291 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 TPM1P09493 284 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 MAP3K10Q02779 954 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 PPATQ06203 517 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 PAK1Q13153 545 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 TAF3Q5VWG9 929 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 ZSCAN12O43309 604 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 CETPP11597 493 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 SNAPC2Q13487 334 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 NR1I3Q14994 352 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 STK17AQ9UEE5 414 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 ARHGAP6O43182 974 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 CEP135Q66GS9 1140 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 FAM196BA6NMK8 535 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 STX10O60499 249 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 ATP2B2Q01814 1243 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 CALCRLQ16602 461 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 TMX1Q9H3N1 280 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 PSMA7O14818 248 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 RHOBTB3O94955 611 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 SLC1A4P43007 532 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 ARID5BQ14865 1188 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 KIF18AQ8NI77 898 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 MYH4Q9Y623 1939 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 ADAMTS3O15072 1205 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 MOGSQ13724 837 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 TRIM14Q14142 442 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 CCDC51Q96ER9 411 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 CPVLQ9H3G5 476 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 STK24Q9Y6E0 443 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 HTTP42858 3142 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 RGS19P49795 217 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 SLFN13Q68D06 897 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 GMCL1Q96IK5 515 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 MTMR9Q96QG7 549 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 TRIM17Q9Y577 477 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 BICDL2A1A5D9 508 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 USP11P51784 963 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 SP3Q02447 781 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 ICA1Q05084 483 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS2-203ENST00000570979 SYCP1Q15431 976 aa21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms