RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 PIBF1Q8WXW3 757 aa33.95■■■■□ 3.03
RAB40C-211ENST00000568586 REC8O95072 547 aa33.94■■■■□ 3.02
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RAB40C-211ENST00000568586 MFSD5Q6N075 450 aa33.94■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa33.94■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
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RAB40C-211ENST00000568586 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa33.93■■■■□ 3.02
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RAB40C-211ENST00000568586 KCNV1Q6PIU1 500 aa33.93■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 MICU3Q86XE3 530 aa33.93■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 IL31RAQ8NI17 732 aa33.93■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 TCEANC2Q96MN5 208 aa33.93■■■■□ 3.02
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RAB40C-211ENST00000568586 EPHB4P54760 987 aa33.92■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 FPGSQ05932 587 aa33.92■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 C9orf50Q5SZB4 431 aa33.92■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 FCHSD1Q86WN1 690 aa33.92■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa33.92■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 FBXL16Q8N461 479 aa33.92■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
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RAB40C-211ENST00000568586 TGFB3P10600 412 aa33.91■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 CCND2P30279 289 aa33.91■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 FUT2Q10981 343 aa33.91■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 AFG1LQ8WV93 481 aa33.91■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 MRVI1Q9Y6F6 885 aa33.91■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 B4GALT4O60513 344 aa33.9■■■■□ 3.02
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RAB40C-211ENST00000568586 TRPV6Q9H1D0 765 aa33.9■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 ZBTB43O43298 467 aa33.89■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 STAM2O75886 525 aa33.89■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 MMP3P08254 477 aa33.89■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 LAMC2Q13753 1193 aa33.89■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 NFRKBQ6P4R8 1299 aa33.89■■■■□ 3.02
RAB40C-211ENST00000568586 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
RAB40C-211ENST00000568586 NBPF20Q3BBV1 942 aa33.88■■■■□ 3.01
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L6PQ6QN14 398 aa33.88■■■■□ 3.01
RAB40C-211ENST00000568586 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
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RAB40C-211ENST00000568586 AGXT2Q9BYV1 514 aa33.87■■■■□ 3.01
RAB40C-211ENST00000568586 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa33.86■■■■□ 3.01
RAB40C-211ENST00000568586 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa33.86■■■■□ 3.01
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RAB40C-211ENST00000568586 MYSM1Q5VVJ2 828 aa33.86■■■■□ 3.01
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RAB40C-211ENST00000568586 TEX2Q8IWB9 1127 aa33.86■■■■□ 3.01
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RAB40C-211ENST00000568586 TMEM199Q8N511 208 aa33.85■■■■□ 3.01
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RAB40C-211ENST00000568586 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
RAB40C-211ENST00000568586 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
RAB40C-211ENST00000568586 RASIP1Q5U651 963 aa33.8■■■■□ 3
RAB40C-211ENST00000568586 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
RAB40C-211ENST00000568586 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP33.8■■■■□ 3
RAB40C-211ENST00000568586 V9GY48 417 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
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