RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562664.5

PPP4C-204, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 3

Gene PPP4C, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-204	ENST00000562664	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	ACTN1	P12814	892 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	IGFBP4	P22692	258 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	PDE4A	P27815	886 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	HSD17B4	P51659	736 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	BFSP2	Q13515	415 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	THEG	Q9P2T0	379 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	NOD1	Q9Y239	953 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	CFB	P00751	764 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	PTGIS	Q16647	500 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	RETREG2	Q8NC44	543 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	SLC9A7	Q96T83	725 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	AMN	Q9BXJ7	453 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-204	ENST00000562664	NCOR1	O75376	2440 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	NR3C2	P08235	984 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	CHMP4BP1	P59074	171 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	CHST3	Q7LGC8	479 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	KLRF2	D3W0D1	207 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	CA3	P07451	260 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	TTC22	Q5TAA0	569 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	CAGE1	Q8TC20	777 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	ZBTB5	O15062	677 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	RGS20	O76081	388 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	RBL2	Q08999	1139 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	DGKD	Q16760	1214 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	27.54	■■■□□ 2	2e-10	■■■□□ 16.7
PPP4C-204	ENST00000562664	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	BAIAP3	O94812	1187 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	F2	P00734	622 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	CYP21A2	P08686	494 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	GPNMB	Q14956	572 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	PPTC7	Q8NI37	304 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	ASB2	Q96Q27	587 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	HAS3	O00219	553 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	ARHGEF15	O94989	841 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	PSEN2	P49810	448 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	GRM4	Q14833	912 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	IL31RA	Q8NI17	732 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-204	ENST00000562664	ZNF286B	P0CG31	522 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	SELP	P16109	830 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	PTH1R	Q03431	593 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	LAMC2	Q13753	1193 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	SENP2	Q9HC62	589 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	EPOP	A6NHQ4	379 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	TRDN	Q13061	729 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	MFSD10	Q14728	455 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	PGM5	Q15124	567 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	HOMER1	Q86YM7	354 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	ALG1	Q9BT22	464 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	TNFRSF10A	O00220	468 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	RFXAP	O00287	272 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	CXCL10	P02778	98 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	CHML	P26374	656 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	TAP1	Q03518	808 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-204	ENST00000562664	C7orf31	Q8N865	590 aa		27.49	■■□□□ 1.99

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