RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 TICAM2Q86XR7 235 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 TBC1D5Q92609 795 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 KAT2BQ92831 832 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAF1Q9H063 256 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 REV3LO60673 3130 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 PTPRSQ13332 1948 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCHNA4D1U4 455 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 LPXNO60711 386 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 DEFB103AP81534 67 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPNMBQ14956 572 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 DGKDQ16760 1214 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 C7orf31Q8N865 590 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 PNMA1Q8ND90 353 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 IWS1Q96ST2 819 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 RMDN3Q96TC7 470 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 NEDD4P46934 1319 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 CKBP12277 381 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 IQCA1Q86XH1 822 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 ALG1Q9BT22 464 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 KAT14Q9H8E8 782 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL20A1Q9P218 1284 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF213O14771 459 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 NBNO60934 754 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 CXCL10P02778 98 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 RBL2Q08999 1139 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 RILPL2Q969X0 211 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 GJB5O95377 273 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 PSEN2P49810 448 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 FBXO11Q86XK2 927 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 RAD9AQ99638 391 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRANK1O15050 2925 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 EFCAB14O75071 495 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 KDM4AO75164 1064 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF286BP0CG31 522 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 NT5C2P49902 561 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 PTK7Q13308 1070 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 LAMC2Q13753 1193 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 IKBKEQ14164 716 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 MFSD10Q14728 455 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 F2P00734 622 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 TCTN1Q2MV58 587 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPTC7Q8NI37 304 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 PXMP2Q9NR77 195 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC01553A4QN01 128 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 CFBP00751 764 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 NR3C2P08235 984 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 SDSP20132 328 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERVK-21P61565 698 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANKS1AQ92625 1134 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 LNPKQ9C0E8 428 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYH6P13533 1939 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 B4E1Z4 1266 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 HAS3O00219 553 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 LAMA4Q16363 1823 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 LGR5O75473 907 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms