RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559589.1

AC100839.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC100839.1, Length 577 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC100839.1-201ENST00000559589 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.2■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 BADQ92934 168 aa22.2■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 BRF1Q92994 677 aa22.2■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 A6NJR5 290 aa22.19■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 KIAA0355O15063 1070 aa22.19■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 SLC34A2O95436 690 aa22.19■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 PSMA5P28066 241 aa22.19■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 ITGA7Q13683 1181 aa22.19■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.19■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.19■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 PIK3CDO00329 1044 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 MYL3P08590 195 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 RCAN1P53805 252 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 ARHGAP1Q07960 439 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 FBXL16Q8N461 479 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 AFG1LQ8WV93 481 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 TBX21Q9UL17 535 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.18■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 LTBP2Q14767 1821 aa22.17■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 GH1P01241 217 aa22.17■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 CCND2P30279 289 aa22.17■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 TDHQ8IZJ6 230 aa22.17■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.17■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.17■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.17■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 CD4P01730 458 aa22.16■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 RAG1P15918 1043 aa22.16■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.16■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.16■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 CUL5Q93034 780 aa22.16■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 UBE2SQ16763 222 aa22.15■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 RUFY3Q7L099 469 aa22.15■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.15■■□□□ 1.14
AC100839.1-201ENST00000559589 MMP3P08254 477 aa22.14■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 SP2Q02086 613 aa22.14■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.14■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 NID2Q14112 1375 aa22.13■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 SORBS3O60504 671 aa22.13■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 B4GALT4O60513 344 aa22.13■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 KPNA6O60684 536 aa22.13■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.13■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.13■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.13■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 STXBP3O00186 592 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 TIMP1P01033 207 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 EPHB4P54760 987 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 NAPAP54920 295 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 EVCP57679 992 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 LAMC2Q13753 1193 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 LRCH3Q96II8 777 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.12■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 GGPS1O95749 300 aa22.11■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 TGFB3P10600 412 aa22.11■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 SEMA3FQ13275 785 aa22.11■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 SHHQ15465 462 aa22.11■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.11■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.11■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.11■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.11■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.11■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.1■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 STAM2O75886 525 aa22.1■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 ICAM3P32942 547 aa22.1■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 PPTC7Q8NI37 304 aa22.1■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 KAT2BQ92831 832 aa22.1■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AC100839.1-201ENST00000559589 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms