RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC42Q96M95 316 aa22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP1R2P41236 205 aa22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDIA5Q14554 519 aa22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 HDXQ7Z353 690 aa22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.22■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 CACNB3P54284 484 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAB34Q9BZG1 259 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 LTBP1Q14766 1721 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L15C9J2P7 530 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L11C9JVI0 530 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L18D6R9N7 530 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L22D6RA61 530 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L19D6RCP7 530 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L20D6RJB6 530 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERLIN1O75477 346 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L24Q0WX57 530 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 FIGNQ5HY92 759 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.21■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A1W2PQJ5 194 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 MARCH6O60337 910 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZMYND10O75800 440 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 CUL5Q93034 780 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 COA1Q9GZY4 146 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYH10P35580 1976 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 EHHADHQ08426 723 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAN2A1Q16706 1144 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 SP8Q8IXZ3 490 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 DRC1Q96MC2 740 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.2■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC53A6NM62 1247 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 VAV2P52735 878 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF5AQ12840 1032 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 CASP8Q14790 479 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 RRAGAQ7L523 313 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 HINFPQ9BQA5 517 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 JADE2Q9NQC1 790 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYH4Q9Y623 1939 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 E9PMD0 336 aa22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 COASYQ13057 564 aa22.19■■□□□ 1.14
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AFG3L1P-217ENST00000557444 ZBTB5O15062 677 aa22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP14P54578 494 aa22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 TUBB4BP68371 445 aa22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM193AP78312 1265 aa22.18■■□□□ 1.14
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AFG3L1P-217ENST00000557444 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJC18Q9H819 358 aa22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.18■■□□□ 1.14
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AFG3L1P-217ENST00000557444 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF11P52732 1056 aa22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCP10Q12799 353 aa22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPA17Q15506 151 aa22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAM21Q9UKJ8 722 aa22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDK17Q00537 523 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNAP25P60880 206 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 APBA1Q02410 837 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC63Q05C16 580 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDR93Q6P2C0 686 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAGE1Q8TC20 777 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 VPS18Q9P253 973 aa22.17■■□□□ 1.14
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