RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554497.1

TMEM30B-201, Transcript of transmembrane protein 30B, humanhuman

TSL 4

Gene TMEM30B, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30B-201ENST00000554497 EDAQ92838 391 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 VTA1Q9NP79 307 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 NYAP2Q9P242 653 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 LAMA4Q16363 1823 aa14.71□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 TMEM221A6NGB7 291 aa14.7□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 M0R296 226 aa14.7□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CPT1AP50416 773 aa14.7□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.7□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 PTPROQ16827 1216 aa14.7□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.7□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 FEM1BQ9UK73 627 aa14.7□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 NOD1Q9Y239 953 aa14.7□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 ZNF213O14771 459 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 NBNO60934 754 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 RASA1P20936 1047 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 LTBRP36941 435 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 TRIM67Q6ZTA4 783 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 MORC4Q8TE76 937 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CLDND1Q9NY35 253 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 PRDM1O75626 825 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 REC8O95072 547 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CXCL10P02778 98 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 SELPP16109 830 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 PDE4BQ07343 736 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CLUL1Q15846 466 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 PTGISQ16647 500 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 EPC2Q52LR7 807 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 RPAINQ86UA6 219 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CAGE1Q8TC20 777 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 MAP4K1Q92918 833 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 MBTPS2O43462 519 aa14.67□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 ALAS1P13196 640 aa14.67□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 PKN1Q16512 942 aa14.67□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 FBXL6Q8N531 539 aa14.67□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.67□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 TOMM22Q9NS69 142 aa14.67□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 INSL6Q9Y581 213 aa14.67□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.67□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CHMP4BP1P59074 171 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 GPM6BQ13491 265 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 TKFCQ3LXA3 575 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 INCENPQ9NQS7 918 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 NEDD4P46934 1319 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 COL4A6Q14031 1691 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 H3BNC9 293 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 EFCAB14O75071 495 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 CYP21A2P08686 494 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 FDX1P10109 184 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 RBL2Q08999 1139 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 IKBKEQ14164 716 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 C8orf34Q49A92 452 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 NSMFQ6X4W1 530 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms