RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	DEXI	O95424	95 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	UBE2S	Q16763	222 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	IL31RA	Q8NI17	732 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	DPF3	Q92784	378 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	C6orf50	Q9HD87	102 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	RABEP1	Q15276	862 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	KIF2C	Q99661	725 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	ZEB2	O60315	1214 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	PPFIA3	O75145	1194 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	GNA11	P29992	359 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	AP3B2	Q13367	1082 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	MCTP2	Q6DN12	878 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	STK36	Q9NRP7	1315 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	ACLY	P53396	1101 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	KCNA10	Q16322	511 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	ME3	Q16798	604 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	BICD2	Q8TD16	824 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	GTF3C6	Q969F1	213 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	MYADML2	A6NDP7	307 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	EVI5	O60447	810 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	CPT1A	P50416	773 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	GH1	P01241	217 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	TGFB3	P10600	412 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	FERMT2	Q96AC1	680 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	BACH2	Q9BYV9	841 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292		A0A1W2PQY0	241 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	CTAGE5	O15320	804 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	ST18	O60284	1047 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	ARIH2	O95376	493 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	LARGE1	O95461	756 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	ASGR1	P07306	291 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	BEX3	Q00994	111 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	ANO3	Q9BYT9	981 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	CABYR	O75952	493 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	RGS20	O76081	388 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	NLRX1	Q86UT6	975 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	NECAB1	Q8N987	351 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	WASF1	Q92558	559 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PCNX1-206	ENST00000554292	XBP1	P17861	261 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	NLRP5	P59047	1200 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	LY6K	Q17RY6	165 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	COPS5	Q92905	334 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	ELP1	O95163	1332 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	CEP290	O15078	2479 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	FIBP	O43427	364 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	CDHR1	Q96JP9	859 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	PTGS1	P23219	599 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	ICAM3	P32942	547 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	SNX17	Q15036	470 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	KPNA6	O60684	536 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	LAMC2	Q13753	1193 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	GALNT17	Q6IS24	598 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79

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