RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550974.1

GPN3-208, Transcript of GPN-loop GTPase 3, human

TSL 5

Gene GPN3, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPN3-208	ENST00000550974	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	CAMK1	Q14012	370 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	RUBCN	Q92622	972 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	WNT8B	Q93098	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	ATRX	P46100	2492 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	PI15	O43692	258 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	AR	P10275	920 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	PDE4B	Q07343	736 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	PTK7	Q13308	1070 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	SUSD6	Q92537	303 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPN3-208	ENST00000550974	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	LINC00271	P0C7V0	271 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	DNAJB1	P25685	340 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	SEPT8	Q92599	483 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	MYH8	P13535	1937 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	ADRB1	P08588	477 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	SDHB	P21912	280 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	MTX1	Q13505	466 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	CHD6	Q8TD26	2715 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	PRKAB2	O43741	272 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	AOC1	P19801	751 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	THPO	P40225	353 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	KAT2B	Q92831	832 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	APOL5	Q9BWW9	433 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	TLE6	Q9H808	572 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	PER2	O15055	1255 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	FDX1	P10109	184 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	SNAP25	P60880	206 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	ZNF292	O60281	2723 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	TMEM232	C9JQI7	657 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	MMP3	P08254	477 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	DMWD	Q09019	674 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	POF1B	Q8WVV4	589 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GPN3-208	ENST00000550974	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25

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