RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 TMEM260Q9NX78 707 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 STK24Q9Y6E0 443 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MARCH6O60337 910 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 NEMFO60524 1076 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PPP6R2O75170 966 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 GABBR2O75899 941 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 NR3C2P08235 984 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ADORA2AP29274 412 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PDE4DQ08499 809 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MAP2K5Q13163 448 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 SLC39A14Q15043 492 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PGM5Q15124 567 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 LETM2Q2VYF4 491 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 CEP55Q53EZ4 464 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MORN1Q5T089 497 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 SLC30A10Q6XR72 485 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 VSIG10LQ86VR7 867 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 RASGRP4Q8TDF6 673 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TBC1D5Q92609 795 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 GPRASP2Q96D09 838 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 SPATA32Q96LK8 384 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 FAM20AQ96MK3 541 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MBOAT7Q96N66 472 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TAAR1Q96RJ0 339 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PDCD2LQ9BRP1 358 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 NRBP1Q9UHY1 535 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 RCOR1Q9UKL0 485 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 DDX11L8A8MPP1 907 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 GPR25O00155 361 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 SPTLC2O15270 562 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 FKTNO75072 461 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TGFB3P10600 412 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PSMC4P43686 418 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TMEM266Q2M3C6 531 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ZNF792Q3KQV3 632 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MORC4Q8TE76 937 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MXRA8Q9BRK3 442 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 LCTP09848 1927 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MEIS1O00470 390 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 SLC26A4O43511 780 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TBC1D8O95759 1140 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ATP2B1P20020 1258 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 EDNRBP24530 442 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MCM7P33993 719 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PTGDRQ13258 359 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PDIA5Q14554 519 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ZNF174Q15697 407 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 CALCRLQ16602 461 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 OLFML2BQ68BL8 750 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 DTHD1Q6ZMT9 781 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 LINC00301Q8NCQ3 95 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 AK8Q96MA6 479 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 USP28Q96RU2 1077 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 APBA2Q99767 749 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 VTA1Q9NP79 307 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 JADE2Q9NQC1 790 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TBC1D22BQ9NU19 505 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 COL20A1Q9P218 1284 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 DOCK3Q8IZD9 2030 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 SOWAHBA6NEL2 793 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 FIBPO43427 364 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 CUTAO60888 179 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PGK2P07205 417 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 OR52Z1P0C646 297 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ICAM3P32942 547 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 LONP1P36776 959 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ME1P48163 572 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 HTRA3P83110 453 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 CNTN2Q02246 1040 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MTMR1Q13613 665 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PTPAQ15257 358 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PRR16Q569H4 304 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ADALQ6DHV7 355 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PLA2G4DQ86XP0 818 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms