RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	PDE4A	P27815	886 aa		18.68	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	HSD17B4	P51659	736 aa		18.68	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		18.68	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	KAT2B	Q92831	832 aa		18.68	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		18.68	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	OPLAH	O14841	1288 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	ZBTB5	O15062	677 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	TRDN	Q13061	729 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	DGKD	Q16760	1214 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	TTC22	Q5TAA0	569 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	SESTD1	Q86VW0	696 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MTMR8	Q96EF0	704 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	SLC9A7	Q96T83	725 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	THEG	Q9P2T0	379 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	VCAN	P13611	3396 aa		18.67	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	GHRHR	Q02643	423 aa		18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	LAMC2	Q13753	1193 aa		18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	CAGE1	Q8TC20	777 aa		18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		18.66	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	TET1	Q8NFU7	2136 aa		18.65	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	CA3	P07451	260 aa		18.65	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PSEN2	P49810	448 aa		18.65	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		18.65	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		18.65	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		18.65	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	ALG1	Q9BT22	464 aa		18.65	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		18.65	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		18.65	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	KIF28P	B7ZC32	967 aa		18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	CYP21A2	P08686	494 aa		18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SELP	P16109	830 aa		18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	PTH1R	Q03431	593 aa		18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	HOMER1	Q86YM7	354 aa		18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	C7orf31	Q8N865	590 aa		18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	PPTC7	Q8NI37	304 aa		18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ASB2	Q96Q27	587 aa		18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		18.64	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ERICH2	A1L162	156 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	RFXAP	O00287	272 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	RGS20	O76081	388 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	BAIAP3	O94812	1187 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	CHML	P26374	656 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TRAF1	Q13077	416 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	MFSD10	Q14728	455 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	GRM4	Q14833	912 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	PGM5	Q15124	567 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	PIGS	Q96S52	555 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	CERS4	Q9HA82	394 aa		18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	HAS3	O00219	553 aa		18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	POLR2M	P0CAP2	368 aa		18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF286B	P0CG31	522 aa		18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	KCNJ6	P48051	423 aa		18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	GPNMB	Q14956	572 aa		18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	WTAP	Q15007	396 aa		18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SENP2	Q9HC62	589 aa		18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TNFRSF10A	O00220	468 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SORBS3	O60504	671 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	PPFIA4	O75335	1185 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	GGPS1	O95749	300 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	F2	P00734	622 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	CKB	P12277	381 aa		18.61	■□□□□ 0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms