RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 MYL3P08590 195 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 GRIN2DO15399 1336 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 ZEB2O60315 1214 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 CLTBP09497 229 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 ITGB8P26012 769 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 CCND2P30279 289 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 ARHGAP1Q07960 439 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 AFG1LQ8WV93 481 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 CUL5Q93034 780 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 ARVCFO00192 962 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 SEC24BO95487 1268 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 CPT1AP50416 773 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 CDK7P50613 346 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 RCAN1P53805 252 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 FAAP100Q0VG06 881 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 NID2Q14112 1375 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 STXBP3O00186 592 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PIK3CDO00329 1044 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 GH1P01241 217 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 NAPAP54920 295 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 ITGA7Q13683 1181 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 FBXL16Q8N461 479 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 BADQ92934 168 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PHKBQ93100 1093 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PGBD1Q96JS3 809 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 SZT2Q5T011 3432 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 A6NJR5 290 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 CABYRO75952 493 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 MMP3P08254 477 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 CHMP4BP1P59074 171 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 SP2Q02086 613 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 TOX2Q96NM4 488 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 BMP8BP34820 402 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 STK3Q13188 491 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 SEMA3FQ13275 785 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 TBX21Q9UL17 535 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 KIAA0355O15063 1070 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 ADAMTS3O15072 1205 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 GGPS1O95749 300 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 EVCP57679 992 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 NTRK3Q16288 839 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM260Q9NX78 707 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 BARHL2Q9NY43 387 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 B4GALT4O60513 344 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 DTNBO60941 627 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 SCG2P13521 617 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 RAG1P15918 1043 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 ADCY7P51828 1080 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PKN1Q16512 942 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-211ENST00000531385 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.52■■□□□ 1.04
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