RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529795.1

PACS1-210, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 448 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-210ENST00000529795 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 TIMP1P01033 207 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 MYL3P08590 195 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 DGKDQ16760 1214 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 TMEM199Q8N511 208 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 BADQ92934 168 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PACS1-210ENST00000529795 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 RXRAP19793 462 aa14.64□□□□□ -0.07
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PACS1-210ENST00000529795 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.077e-6■□□□□ 9.9
PACS1-210ENST00000529795 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 CDHR1Q96JP9 859 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 PPFIA4O75335 1185 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 RPS6KB1P23443 525 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 NEDD9Q14511 834 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 LY6KQ17RY6 165 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 MCTP2Q6DN12 878 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 MFSD5Q6N075 450 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 Q6ZUG5 572 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 NLRX1Q86UT6 975 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 TBX21Q9UL17 535 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 MAFGO15525 162 aa14.62□□□□□ -0.07
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PACS1-210ENST00000529795 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 RUFY3Q7L099 469 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.62□□□□□ -0.07
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PACS1-210ENST00000529795 BRF1Q92994 677 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 USP26Q9BXU7 913 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 MEIS2O14770 477 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 FIBPO43427 364 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 ARIH2O95376 493 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 MMP3P08254 477 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 ICAM3P32942 547 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 NAPAP54920 295 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 ARHGAP1Q07960 439 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 AFG1LQ8WV93 481 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 COPS5Q92905 334 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-210ENST00000529795 HIPK3Q9H422 1215 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 NOD1Q9Y239 953 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-210ENST00000529795 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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PACS1-210ENST00000529795 SPATA33Q96N06 139 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 BARHL2Q9NY43 387 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 KAT6AQ92794 2004 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACS1-210ENST00000529795 GGPS1O95749 300 aa14.59□□□□□ -0.07
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