RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517345.5

LINC02055-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2055, humanhuman

TSL 3

Gene LINC02055, Length 439 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC02055-201ENST00000517345 PRODHO43272 600 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 DLX3O60479 287 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 FSHBP01225 129 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 MPOP05164 745 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 LCP1P13796 627 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 CORO7P57737 925 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 RASA3Q14644 834 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 RAB3GAP1Q15042 981 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 MTERF2Q49AM1 385 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 BICRALQ6AI39 1079 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 CCDC140Q96MF4 163 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 PWWP2AQ96N64 755 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 DEPDC7Q96QD5 511 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 MTA3Q9BTC8 594 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 SPATA9Q9BWV2 254 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 SNTG2Q9NY99 539 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 KLHL14Q9P2G3 628 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 A0A1W2PQJ5 194 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 K7ESM1 405 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 ADCY3O60266 1144 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 NPHS1O60500 1241 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 CPP00450 1065 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 SOGA3Q5TF21 947 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 FOXB2Q5VYV0 432 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 RPTNQ6XPR3 784 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 PPIL6Q8IXY8 311 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 LZTR1Q8N653 840 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 MZB1Q8WU39 189 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 DNAJC7Q99615 494 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 BTG4Q9NY30 223 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 PALD1Q9ULE6 856 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 KDM2BQ8NHM5 1336 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 BLACEA4D250 179 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 MATN3O15232 486 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 FUCA1P04066 466 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 DBHP09172 617 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 FAM153BP0C7A2 387 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 GLI4P10075 376 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 FGFR1P11362 822 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 MAP4K2Q12851 820 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 NTRK3Q16288 839 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 ZNF827Q17R98 1081 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 IQCEQ6IPM2 695 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 NSMFQ6X4W1 530 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 FERMT3Q86UX7 667 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 USP33Q8TEY7 942 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 DIO2Q92813 273 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 OSBP2Q969R2 916 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 SRRDQ9UH36 339 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 HRKO00198 91 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 SRGAP3O43295 1099 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 CYBBP04839 570 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 LTBRP36941 435 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 BCL6P41182 706 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 NCKAP1LP55160 1127 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 TESK1Q15569 626 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 USP53Q70EK8 1073 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 TMC6Q7Z403 805 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 UBXN4Q92575 508 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 MKL1Q969V6 931 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 OSBPL2Q9H1P3 480 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa4.97□□□□□ -1.61
LINC02055-201ENST00000517345 C22orf46C9J442 243 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC02055-201ENST00000517345 F8W031 263 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
LINC02055-201ENST00000517345 MSCO60682 206 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC02055-201ENST00000517345 NTRK1P04629 796 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC02055-201ENST00000517345 FPR2P25090 351 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC02055-201ENST00000517345 KCNC1P48547 511 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC02055-201ENST00000517345 RPL11P62913 178 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
LINC02055-201ENST00000517345 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
LINC02055-201ENST00000517345 KCNAB2Q13303 367 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC02055-201ENST00000517345 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms