RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516042.1

RNU6-772P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 772, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-772P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-772P-201ENST00000516042 PRIMA1Q86XR5 153 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 IFNL2Q8IZJ0 200 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 FUKQ8N0W3 1084 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATG4CQ96DT6 458 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLIP3Q96DZ5 547 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 YIPF4Q9BSR8 244 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 CROTQ9UKG9 612 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 FHOD1Q9Y613 1164 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 PLSCR1O15162 318 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 FOXN1O15353 648 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAD17O75943 681 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 LDHBP07195 334 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDK4P11802 303 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ST13P50502 369 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 CR1LQ2VPA4 569 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 POLNQ7Z5Q5 900 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 FIBCD1Q8N539 461 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 FBXO27Q8NI29 283 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 SEC14L1Q92503 715 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM89AQ96GI7 184 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 BRIP1Q9BX63 1249 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM191CA6NGB0 347 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 TNFRSF10CO14798 259 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATE1O95260 518 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 NUDT3O95989 172 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 P4HBP07237 508 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 CTGFP29279 349 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF445P59923 1031 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM160A1Q05DH4 1040 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 FSTL1Q12841 308 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF568Q3ZCX4 644 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 Q6ZPA2 131 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 TAX1BP1Q86VP1 789 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ULK2Q8IYT8 1036 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 BRF1Q92994 677 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 AK5Q9Y6K8 562 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 C9IYK1 514 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 STXBP3O00186 592 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 TLR3O15455 904 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 SGSM2O43147 1006 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 FUCA1P04066 466 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 NME1P15531 152 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC6A11P48066 632 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM196AQ6ZSG2 479 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 Q6ZSN1 163 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 GOLM1Q8NBJ4 401 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZDHHC15Q96MV8 337 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM74Q96NL1 305 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ASB16Q96NS5 453 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM209Q96SK2 561 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 LRRC3Q9BY71 257 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 GP6Q9HCN6 339 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 BRMS1Q9HCU9 246 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 MEIS3P2A8K0S8 358 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 NPHS1O60500 1241 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ITGA4P13612 1032 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 COLEC12Q5KU26 742 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 DCAF15Q66K64 600 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 GPR155Q7Z3F1 870 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 MILR1Q7Z6M3 343 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 CPNE8Q86YQ8 564 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCDC82Q8N4S0 544 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 NUDT10Q8NFP7 164 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 NUDT11Q96G61 164 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 DHRS1Q96LJ7 313 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-772P-201ENST00000516042 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 AURKAO14965 403 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 KLHL18O94889 574 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 LMNAP02545 664 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 COL6A1P12109 1028 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 PAMP19021 973 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 CSF2RBP32927 897 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 SEPHS1P49903 392 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAC3P60763 192 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 PWP1Q13610 501 aa2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms